Die Unkrautflora in Sonnenblumen wird weitgehend von den anderen Kulturen in der Fruchtfolge bestimmt. In Fruchtfolgen mit Getreide und Mais treten vor allem Problemunkräuter aus dem Mais auf.
Im Kartoffelanbau treten vorwiegend sommerannuelle Unkräuter auf, und zwar Weißer Gänsefuß, Spreizende Melde, Knöterich-Arten und Arten mit langer Keimperiode, wie Purpurrote Taubnessel, Vogelmiere, Einjähriges Rispengras und Acker-Fuchsschwanz.